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日本商标注册的流程图大致如下。
1、申请人提交申请：申请人可以通过本国商标代理机构或直接向日本特许厅提交商标注册申请，提交申请时应提交商标图样、商品或服务分类列表以及申请人信息。
2、商标审查：日本特许厅会对提交的申请进行审查，包括形式审查和实质审查，形式审查主要审查申请文件是否齐全，实质审查则涉及商标是否符合法律规定以及是否具有可注册性。
3、商标审查结果通知：日本特许厅会向申请人发出审查结果通知，如果申请被接受，将会进入公告阶段；如果被拒绝，将通知拒绝理由。
4、商标公告：接受审查的商标将在官方公报上进行公告，任何第三方都可以在公告期内提出异议。
5、注册证书颁发：如果在公告期内没有收到异议或异议被解决，日本特许厅将颁发注册证书，确认商标注册。
流程可能因具体情况而略有不同，建议在进行日本商标注册前咨询专业的商标代理机构或律师，以确保注册过程顺利进行。